Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema3fO88632 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sema3fO88632 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema3fO88632 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema3fO88632 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema3fO88632 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sema3fO88632 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sema3fO88632 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sema3fO88632 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema3fO88632 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema3fO88632 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema3fO88632 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema3fO88632 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema3fO88632 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema3fO88632 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sema3fO88632 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema3fO88632 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema3fO88632 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema3fO88632 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema3fO88632 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema3fO88632 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema3fO88632 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3fO88632 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3fO88632 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3fO88632 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3fO88632 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3fO88632 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3fO88632 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3fO88632 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3fO88632 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3fO88632 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3fO88632 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3fO88632 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3fO88632 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3fO88632 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3fO88632 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3fO88632 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema3fO88632 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema3fO88632 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema3fO88632 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema3fO88632 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Sema3fO88632 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema3fO88632 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema3fO88632 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3fO88632 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3fO88632 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3fO88632 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3fO88632 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3fO88632 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3fO88632 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sema3fO88632 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3fO88632 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3fO88632 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3fO88632 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3fO88632 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3fO88632 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3fO88632 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3fO88632 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3fO88632 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sema3fO88632 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3fO88632 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3fO88632 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema3fO88632 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema3fO88632 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sema3fO88632 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sema3fO88632 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Sema3fO88632 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema3fO88632 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema3fO88632 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema3fO88632 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema3fO88632 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema3fO88632 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sema3fO88632 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema3fO88632 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema3fO88632 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema3fO88632 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms