Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cops6O88545 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cops6O88545 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cops6O88545 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cops6O88545 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cops6O88545 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cops6O88545 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cops6O88545 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cops6O88545 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cops6O88545 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cops6O88545 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cops6O88545 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cops6O88545 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cops6O88545 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cops6O88545 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cops6O88545 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cops6O88545 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cops6O88545 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cops6O88545 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cops6O88545 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cops6O88545 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cops6O88545 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cops6O88545 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cops6O88545 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cops6O88545 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cops6O88545 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cops6O88545 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cops6O88545 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cops6O88545 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cops6O88545 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cops6O88545 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cops6O88545 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cops6O88545 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cops6O88545 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cops6O88545 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cops6O88545 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cops6O88545 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cops6O88545 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cops6O88545 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cops6O88545 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms