Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnmt3bO88509 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnmt3bO88509 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms