Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nptx2O70340 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nptx2O70340 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nptx2O70340 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nptx2O70340 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nptx2O70340 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nptx2O70340 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nptx2O70340 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nptx2O70340 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nptx2O70340 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nptx2O70340 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nptx2O70340 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nptx2O70340 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nptx2O70340 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nptx2O70340 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nptx2O70340 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nptx2O70340 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nptx2O70340 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nptx2O70340 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nptx2O70340 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nptx2O70340 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nptx2O70340 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nptx2O70340 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nptx2O70340 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nptx2O70340 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nptx2O70340 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nptx2O70340 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nptx2O70340 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nptx2O70340 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nptx2O70340 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nptx2O70340 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nptx2O70340 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nptx2O70340 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nptx2O70340 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nptx2O70340 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nptx2O70340 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nptx2O70340 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nptx2O70340 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms