Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atf5O70191 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atf5O70191 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atf5O70191 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Atf5O70191 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Atf5O70191 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atf5O70191 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atf5O70191 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atf5O70191 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atf5O70191 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atf5O70191 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Atf5O70191 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atf5O70191 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms