Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AurkbO70126 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AurkbO70126 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AurkbO70126 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AurkbO70126 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AurkbO70126 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AurkbO70126 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
AurkbO70126 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AurkbO70126 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AurkbO70126 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AurkbO70126 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AurkbO70126 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AurkbO70126 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AurkbO70126 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AurkbO70126 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AurkbO70126 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AurkbO70126 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AurkbO70126 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AurkbO70126 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AurkbO70126 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AurkbO70126 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AurkbO70126 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AurkbO70126 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AurkbO70126 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AurkbO70126 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AurkbO70126 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AurkbO70126 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms