Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn20O55082 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptpn20O55082 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms