Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TsksO54887 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TsksO54887 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TsksO54887 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TsksO54887 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TsksO54887 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TsksO54887 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TsksO54887 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TsksO54887 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TsksO54887 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TsksO54887 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TsksO54887 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TsksO54887 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TsksO54887 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TsksO54887 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TsksO54887 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TsksO54887 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TsksO54887 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TsksO54887 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TsksO54887 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TsksO54887 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TsksO54887 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TsksO54887 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TsksO54887 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TsksO54887 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TsksO54887 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TsksO54887 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TsksO54887 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TsksO54887 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TsksO54887 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TsksO54887 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TsksO54887 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TsksO54887 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TsksO54887 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TsksO54887 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TsksO54887 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TsksO54887 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TsksO54887 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TsksO54887 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TsksO54887 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TsksO54887 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TsksO54887 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TsksO54887 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TsksO54887 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TsksO54887 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TsksO54887 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TsksO54887 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TsksO54887 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TsksO54887 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TsksO54887 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TsksO54887 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TsksO54887 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TsksO54887 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TsksO54887 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TsksO54887 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TsksO54887 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TsksO54887 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TsksO54887 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TsksO54887 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TsksO54887 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TsksO54887 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TsksO54887 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TsksO54887 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TsksO54887 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TsksO54887 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TsksO54887 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TsksO54887 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TsksO54887 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TsksO54887 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TsksO54887 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TsksO54887 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TsksO54887 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TsksO54887 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TsksO54887 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TsksO54887 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TsksO54887 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TsksO54887 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TsksO54887 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TsksO54887 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TsksO54887 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TsksO54887 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TsksO54887 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TsksO54887 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TsksO54887 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TsksO54887 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TsksO54887 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TsksO54887 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TsksO54887 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TsksO54887 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TsksO54887 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TsksO54887 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TsksO54887 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TsksO54887 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TsksO54887 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TsksO54887 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TsksO54887 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TsksO54887 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TsksO54887 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TsksO54887 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TsksO54887 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms