Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxO54751 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxO54751 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxO54751 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxO54751 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxO54751 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxO54751 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxO54751 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxO54751 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxO54751 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxO54751 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxO54751 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxO54751 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxO54751 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CrxO54751 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxO54751 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxO54751 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxO54751 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxO54751 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxO54751 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxO54751 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxO54751 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxO54751 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxO54751 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxO54751 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxO54751 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxO54751 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxO54751 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxO54751 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxO54751 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxO54751 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxO54751 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CrxO54751 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CrxO54751 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CrxO54751 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CrxO54751 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CrxO54751 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CrxO54751 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CrxO54751 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CrxO54751 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CrxO54751 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CrxO54751 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CrxO54751 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CrxO54751 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CrxO54751 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CrxO54751 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CrxO54751 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CrxO54751 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CrxO54751 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CrxO54751 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CrxO54751 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CrxO54751 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxO54751 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxO54751 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxO54751 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxO54751 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxO54751 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxO54751 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxO54751 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxO54751 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxO54751 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxO54751 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxO54751 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxO54751 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxO54751 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxO54751 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxO54751 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxO54751 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxO54751 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxO54751 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxO54751 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxO54751 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxO54751 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxO54751 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxO54751 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxO54751 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxO54751 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxO54751 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxO54751 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxO54751 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxO54751 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxO54751 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxO54751 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxO54751 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxO54751 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxO54751 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxO54751 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxO54751 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxO54751 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxO54751 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxO54751 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxO54751 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxO54751 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxO54751 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxO54751 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxO54751 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxO54751 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxO54751 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxO54751 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxO54751 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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