Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5r2O35926 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms