Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cited2O35740 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cited2O35740 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cited2O35740 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cited2O35740 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cited2O35740 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cited2O35740 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cited2O35740 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms