Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppfibp2O35711 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfibp2O35711 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms