Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NudcO35685 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NudcO35685 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NudcO35685 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NudcO35685 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NudcO35685 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NudcO35685 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NudcO35685 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NudcO35685 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NudcO35685 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NudcO35685 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NudcO35685 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NudcO35685 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NudcO35685 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NudcO35685 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NudcO35685 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NudcO35685 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NudcO35685 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NudcO35685 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NudcO35685 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NudcO35685 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NudcO35685 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NudcO35685 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NudcO35685 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NudcO35685 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NudcO35685 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NudcO35685 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NudcO35685 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NudcO35685 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NudcO35685 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NudcO35685 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NudcO35685 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NudcO35685 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NudcO35685 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NudcO35685 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NudcO35685 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NudcO35685 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NudcO35685 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NudcO35685 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NudcO35685 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NudcO35685 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NudcO35685 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NudcO35685 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NudcO35685 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NudcO35685 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NudcO35685 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NudcO35685 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
NudcO35685 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NudcO35685 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NudcO35685 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NudcO35685 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NudcO35685 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NudcO35685 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NudcO35685 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NudcO35685 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NudcO35685 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NudcO35685 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NudcO35685 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NudcO35685 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NudcO35685 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NudcO35685 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NudcO35685 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NudcO35685 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NudcO35685 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NudcO35685 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NudcO35685 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NudcO35685 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NudcO35685 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NudcO35685 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NudcO35685 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NudcO35685 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NudcO35685 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NudcO35685 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NudcO35685 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NudcO35685 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NudcO35685 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NudcO35685 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NudcO35685 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NudcO35685 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NudcO35685 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NudcO35685 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NudcO35685 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NudcO35685 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NudcO35685 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NudcO35685 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NudcO35685 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NudcO35685 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NudcO35685 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NudcO35685 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NudcO35685 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NudcO35685 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NudcO35685 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NudcO35685 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NudcO35685 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NudcO35685 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NudcO35685 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NudcO35685 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NudcO35685 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NudcO35685 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NudcO35685 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms