Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1dO35473 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1dO35473 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1dO35473 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1dO35473 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1dO35473 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1dO35473 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1dO35473 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C1dO35473 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1dO35473 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1dO35473 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1dO35473 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1dO35473 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1dO35473 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1dO35473 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1dO35473 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1dO35473 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1dO35473 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1dO35473 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C1dO35473 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C1dO35473 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1dO35473 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1dO35473 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1dO35473 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1dO35473 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1dO35473 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1dO35473 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C1dO35473 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1dO35473 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1dO35473 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1dO35473 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1dO35473 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1dO35473 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1dO35473 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1dO35473 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1dO35473 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1dO35473 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1dO35473 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1dO35473 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1dO35473 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1dO35473 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1dO35473 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1dO35473 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1dO35473 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1dO35473 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1dO35473 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1dO35473 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1dO35473 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1dO35473 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C1dO35473 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1dO35473 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1dO35473 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1dO35473 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1dO35473 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1dO35473 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1dO35473 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1dO35473 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1dO35473 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1dO35473 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C1dO35473 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
C1dO35473 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
C1dO35473 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1dO35473 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1dO35473 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1dO35473 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1dO35473 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1dO35473 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1dO35473 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1dO35473 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1dO35473 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1dO35473 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1dO35473 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1dO35473 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1dO35473 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1dO35473 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C1dO35473 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1dO35473 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1dO35473 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C1dO35473 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1dO35473 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1dO35473 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1dO35473 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1dO35473 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1dO35473 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1dO35473 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1dO35473 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1dO35473 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1dO35473 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1dO35473 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1dO35473 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1dO35473 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1dO35473 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1dO35473 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1dO35473 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C1dO35473 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1dO35473 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1dO35473 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1dO35473 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1dO35473 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C1dO35473 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms