Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn1O35350 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn1O35350 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn1O35350 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn1O35350 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn1O35350 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn1O35350 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Capn1O35350 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn1O35350 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn1O35350 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn1O35350 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn1O35350 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn1O35350 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn1O35350 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn1O35350 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn1O35350 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn1O35350 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn1O35350 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn1O35350 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn1O35350 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn1O35350 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Capn1O35350 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn1O35350 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn1O35350 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn1O35350 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn1O35350 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn1O35350 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn1O35350 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn1O35350 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn1O35350 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn1O35350 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn1O35350 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn1O35350 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn1O35350 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn1O35350 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn1O35350 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Capn1O35350 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn1O35350 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn1O35350 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn1O35350 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn1O35350 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn1O35350 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn1O35350 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Capn1O35350 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms