Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna6O35345 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kpna6O35345 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna6O35345 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna6O35345 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna6O35345 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna6O35345 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna6O35345 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna6O35345 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna6O35345 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna6O35345 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna6O35345 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna6O35345 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna6O35345 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna6O35345 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna6O35345 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna6O35345 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna6O35345 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kpna6O35345 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kpna6O35345 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms