Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna4O35343 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna4O35343 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms