Protein–RNA interactions for Protein: O35214

Rrh, Visual pigment-like receptor peropsin, mousemouse

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Length 337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RrhO35214 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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RrhO35214 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RrhO35214 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RrhO35214 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RrhO35214 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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RrhO35214 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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RrhO35214 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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RrhO35214 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RrhO35214 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RrhO35214 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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RrhO35214 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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RrhO35214 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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RrhO35214 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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RrhO35214 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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RrhO35214 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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RrhO35214 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RrhO35214 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RrhO35214 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RrhO35214 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RrhO35214 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RrhO35214 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RrhO35214 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RrhO35214 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RrhO35214 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RrhO35214 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RrhO35214 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RrhO35214 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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RrhO35214 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RrhO35214 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RrhO35214 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RrhO35214 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RrhO35214 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RrhO35214 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms