Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Kcns1O35173 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms