Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pitx3O35160 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx3O35160 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx3O35160 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx3O35160 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx3O35160 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx3O35160 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx3O35160 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx3O35160 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx3O35160 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx3O35160 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx3O35160 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx3O35160 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx3O35160 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx3O35160 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx3O35160 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx3O35160 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx3O35160 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitx3O35160 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx3O35160 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx3O35160 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx3O35160 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx3O35160 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx3O35160 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx3O35160 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx3O35160 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx3O35160 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx3O35160 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pitx3O35160 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx3O35160 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx3O35160 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx3O35160 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx3O35160 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx3O35160 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx3O35160 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx3O35160 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms