Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc23O35125 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc23O35125 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms