Protein–RNA interactions for Protein: O35118

Gfra3, GDNF family receptor alpha-3, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra3O35118 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra3O35118 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gfra3O35118 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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