Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ArxO35085 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ArxO35085 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ArxO35085 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ArxO35085 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ArxO35085 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ArxO35085 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ArxO35085 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ArxO35085 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ArxO35085 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ArxO35085 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ArxO35085 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ArxO35085 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ArxO35085 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ArxO35085 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ArxO35085 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ArxO35085 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ArxO35085 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ArxO35085 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ArxO35085 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ArxO35085 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ArxO35085 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ArxO35085 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ArxO35085 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ArxO35085 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ArxO35085 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ArxO35085 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ArxO35085 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ArxO35085 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ArxO35085 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ArxO35085 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ArxO35085 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ArxO35085 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ArxO35085 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ArxO35085 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ArxO35085 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ArxO35085 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ArxO35085 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ArxO35085 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ArxO35085 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ArxO35085 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ArxO35085 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ArxO35085 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ArxO35085 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ArxO35085 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ArxO35085 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ArxO35085 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ArxO35085 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ArxO35085 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ArxO35085 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ArxO35085 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ArxO35085 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ArxO35085 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ArxO35085 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ArxO35085 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ArxO35085 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ArxO35085 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ArxO35085 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ArxO35085 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ArxO35085 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ArxO35085 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ArxO35085 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ArxO35085 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ArxO35085 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ArxO35085 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ArxO35085 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ArxO35085 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ArxO35085 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ArxO35085 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ArxO35085 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ArxO35085 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ArxO35085 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ArxO35085 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ArxO35085 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ArxO35085 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ArxO35085 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ArxO35085 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ArxO35085 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ArxO35085 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ArxO35085 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ArxO35085 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ArxO35085 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ArxO35085 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ArxO35085 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ArxO35085 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ArxO35085 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ArxO35085 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ArxO35085 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ArxO35085 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ArxO35085 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ArxO35085 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ArxO35085 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ArxO35085 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ArxO35085 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ArxO35085 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ArxO35085 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ArxO35085 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ArxO35085 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ArxO35085 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ArxO35085 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms