Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casq1O09165 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casq1O09165 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casq1O09165 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Casq1O09165 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casq1O09165 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Casq1O09165 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casq1O09165 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Casq1O09165 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casq1O09165 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Casq1O09165 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Casq1O09165 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Casq1O09165 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
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