Protein–RNA interactions for Protein: O08992

Sdcbp, Syntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdcbpO08992 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SdcbpO08992 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms