Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckarO08786 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckarO08786 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckarO08786 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckarO08786 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckarO08786 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CckarO08786 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CckarO08786 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CckarO08786 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CckarO08786 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CckarO08786 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CckarO08786 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CckarO08786 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CckarO08786 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CckarO08786 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CckarO08786 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CckarO08786 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CckarO08786 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CckarO08786 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CckarO08786 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CckarO08786 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CckarO08786 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CckarO08786 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CckarO08786 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CckarO08786 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CckarO08786 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CckarO08786 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckarO08786 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckarO08786 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckarO08786 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckarO08786 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckarO08786 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckarO08786 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckarO08786 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CckarO08786 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckarO08786 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckarO08786 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckarO08786 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckarO08786 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckarO08786 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckarO08786 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckarO08786 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CckarO08786 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckarO08786 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckarO08786 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckarO08786 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckarO08786 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckarO08786 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckarO08786 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckarO08786 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CckarO08786 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckarO08786 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckarO08786 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckarO08786 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckarO08786 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckarO08786 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckarO08786 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckarO08786 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckarO08786 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckarO08786 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckarO08786 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckarO08786 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckarO08786 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckarO08786 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckarO08786 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckarO08786 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckarO08786 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckarO08786 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckarO08786 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckarO08786 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CckarO08786 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckarO08786 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckarO08786 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckarO08786 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckarO08786 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckarO08786 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckarO08786 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckarO08786 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckarO08786 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckarO08786 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckarO08786 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CckarO08786 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CckarO08786 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckarO08786 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CckarO08786 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckarO08786 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckarO08786 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckarO08786 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckarO08786 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckarO08786 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckarO08786 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckarO08786 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckarO08786 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckarO08786 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckarO08786 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CckarO08786 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckarO08786 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckarO08786 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckarO08786 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CckarO08786 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms