Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm17078M0QW51 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Gm17078M0QW51 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Gm17078M0QW51 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Gm17078M0QW51 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Gm17078M0QW51 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Gm17078M0QW51 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17078M0QW51 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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