Protein–RNA interactions for Protein: L7N219

Gm5458, Predicted gene 5458, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5458L7N219 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5458L7N219 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5458L7N219 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5458L7N219 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5458L7N219 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5458L7N219 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5458L7N219 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5458L7N219 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5458L7N219 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5458L7N219 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5458L7N219 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5458L7N219 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5458L7N219 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5458L7N219 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5458L7N219 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms