Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IfnabL7MTU6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms