Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gm5849J3QPE5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms