Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Gm21976J3QNN2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Gm21976J3QNN2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm21976J3QNN2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21976J3QNN2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21976J3QNN2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Gm21976J3QNN2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21976J3QNN2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Gm21976J3QNN2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21976J3QNN2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21976J3QNN2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21976J3QNN2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21976J3QNN2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21976J3QNN2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21976J3QNN2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Gm21976J3QNN2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21976J3QNN2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21976J3QNN2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21976J3QNN2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21976J3QNN2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21976J3QNN2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21976J3QNN2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21976J3QNN2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21976J3QNN2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21976J3QNN2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21976J3QNN2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21976J3QNN2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21976J3QNN2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21976J3QNN2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21976J3QNN2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21976J3QNN2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21976J3QNN2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21976J3QNN2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21976J3QNN2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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