Protein–RNA interactions for Protein: J3QN01

Ms4a18, Membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 18, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a18J3QN01 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ms4a18J3QN01 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ms4a18J3QN01 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Ms4a18J3QN01 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Ms4a18J3QN01 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Ms4a18J3QN01 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a18J3QN01 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ms4a18J3QN01 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ms4a18J3QN01 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a18J3QN01 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a18J3QN01 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a18J3QN01 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a18J3QN01 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a18J3QN01 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a18J3QN01 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a18J3QN01 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a18J3QN01 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a18J3QN01 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a18J3QN01 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a18J3QN01 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a18J3QN01 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a18J3QN01 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a18J3QN01 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ms4a18J3QN01 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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