Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm20873J3QMQ9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20873J3QMQ9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20873J3QMQ9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20873J3QMQ9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20873J3QMQ9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Gm20873J3QMQ9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20873J3QMQ9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20873J3QMQ9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Gm20873J3QMQ9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20873J3QMQ9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Gm20873J3QMQ9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20873J3QMQ9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Gm20873J3QMQ9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gm20873J3QMQ9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20873J3QMQ9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20873J3QMQ9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20873J3QMQ9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20873J3QMQ9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gm20873J3QMQ9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gm20873J3QMQ9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20873J3QMQ9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Gm20873J3QMQ9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20873J3QMQ9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20873J3QMQ9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Gm20873J3QMQ9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Gm20873J3QMQ9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Gm20873J3QMQ9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20873J3QMQ9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Gm20873J3QMQ9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20873J3QMQ9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20873J3QMQ9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20873J3QMQ9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20873J3QMQ9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20873J3QMQ9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20873J3QMQ9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20873J3QMQ9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20873J3QMQ9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20873J3QMQ9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20873J3QMQ9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20873J3QMQ9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20873J3QMQ9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20873J3QMQ9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20873J3QMQ9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20873J3QMQ9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20873J3QMQ9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20873J3QMQ9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20873J3QMQ9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Gm20873J3QMQ9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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