Protein–RNA interactions for Protein: J3QM57

Gm21783, Predicted gene, 21783, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21783J3QM57 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm21783J3QM57 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21783J3QM57 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21783J3QM57 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21783J3QM57 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21783J3QM57 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21783J3QM57 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21783J3QM57 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21783J3QM57 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21783J3QM57 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21783J3QM57 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21783J3QM57 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21783J3QM57 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21783J3QM57 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21783J3QM57 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21783J3QM57 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21783J3QM57 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21783J3QM57 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21783J3QM57 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21783J3QM57 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm21783J3QM57 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm21783J3QM57 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm21783J3QM57 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21783J3QM57 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21783J3QM57 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21783J3QM57 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm21783J3QM57 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21783J3QM57 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21783J3QM57 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm21783J3QM57 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm21783J3QM57 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm21783J3QM57 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21783J3QM57 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm21783J3QM57 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21783J3QM57 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21783J3QM57 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm21783J3QM57 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm21783J3QM57 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm21783J3QM57 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21783J3QM57 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm21783J3QM57 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm21783J3QM57 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21783J3QM57 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21783J3QM57 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21783J3QM57 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21783J3QM57 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21783J3QM57 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21783J3QM57 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21783J3QM57 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21783J3QM57 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21783J3QM57 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21783J3QM57 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21783J3QM57 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21783J3QM57 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21783J3QM57 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21783J3QM57 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21783J3QM57 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21783J3QM57 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21783J3QM57 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21783J3QM57 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21783J3QM57 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21783J3QM57 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21783J3QM57 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21783J3QM57 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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