Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm20830J3KML6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20830J3KML6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20830J3KML6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20830J3KML6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20830J3KML6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20830J3KML6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20830J3KML6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20830J3KML6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20830J3KML6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20830J3KML6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20830J3KML6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20830J3KML6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm20830J3KML6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20830J3KML6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm20830J3KML6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm20830J3KML6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm20830J3KML6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20830J3KML6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20830J3KML6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm20830J3KML6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20830J3KML6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20830J3KML6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm20830J3KML6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20830J3KML6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20830J3KML6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20830J3KML6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20830J3KML6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20830J3KML6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20830J3KML6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20830J3KML6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20830J3KML6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20830J3KML6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20830J3KML6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20830J3KML6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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