Protein–RNA interactions for Protein: I6L890

Casp16-ps, Caspase 16, apoptosis-related cysteine peptidase, pseudogene, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp16-psI6L890 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casp16-psI6L890 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms