Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Hmgxb3G3X9M3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms