Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Susd5G3UW60 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Susd5G3UW60 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Susd5G3UW60 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Susd5G3UW60 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Susd5G3UW60 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Susd5G3UW60 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Susd5G3UW60 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Susd5G3UW60 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Susd5G3UW60 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Susd5G3UW60 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Susd5G3UW60 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Susd5G3UW60 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Susd5G3UW60 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms