Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20517G3UVU6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20517G3UVU6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20517G3UVU6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20517G3UVU6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20517G3UVU6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms