Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r76F8VQ63 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms