Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms