Protein–RNA interactions for Protein: F6ZIS7

Rarres1, Retinoic acid receptor responder (tazarotene-induced) 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres1F6ZIS7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rarres1F6ZIS7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rarres1F6ZIS7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms