Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm8005F6YKY3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gm8005F6YKY3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gm8005F6YKY3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8005F6YKY3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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