Protein–RNA interactions for Protein: F6VWU8

Zfp946, Zinc finger protein 946, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp946F6VWU8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp946F6VWU8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp946F6VWU8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp946F6VWU8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp946F6VWU8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp946F6VWU8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp946F6VWU8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp946F6VWU8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp946F6VWU8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp946F6VWU8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp946F6VWU8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp946F6VWU8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp946F6VWU8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp946F6VWU8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp946F6VWU8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp946F6VWU8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp946F6VWU8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp946F6VWU8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp946F6VWU8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp946F6VWU8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp946F6VWU8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp946F6VWU8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp946F6VWU8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp946F6VWU8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp946F6VWU8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp946F6VWU8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp946F6VWU8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp946F6VWU8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp946F6VWU8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp946F6VWU8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms