Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933403O08RikF6UK53 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms