Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm21977F6U3N7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21977F6U3N7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms