Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf165E9QAU8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms