Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Gm5407E9Q7Q1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5407E9Q7Q1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5407E9Q7Q1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms