Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Gm17727E9Q4V7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Gm17727E9Q4V7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm17727E9Q4V7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm17727E9Q4V7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm17727E9Q4V7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm17727E9Q4V7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm17727E9Q4V7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm17727E9Q4V7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm17727E9Q4V7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm17727E9Q4V7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm17727E9Q4V7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm17727E9Q4V7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm17727E9Q4V7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm17727E9Q4V7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm17727E9Q4V7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm17727E9Q4V7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm17727E9Q4V7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm17727E9Q4V7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm17727E9Q4V7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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