Protein–RNA interactions for Protein: E9Q411

Nbas, Neuroblastoma-amplified sequence, mousemouse

Predictions only

Length 2,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbasE9Q411 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NbasE9Q411 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NbasE9Q411 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NbasE9Q411 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NbasE9Q411 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NbasE9Q411 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NbasE9Q411 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NbasE9Q411 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NbasE9Q411 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NbasE9Q411 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NbasE9Q411 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NbasE9Q411 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NbasE9Q411 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NbasE9Q411 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NbasE9Q411 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NbasE9Q411 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NbasE9Q411 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NbasE9Q411 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NbasE9Q411 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NbasE9Q411 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NbasE9Q411 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NbasE9Q411 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NbasE9Q411 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NbasE9Q411 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NbasE9Q411 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NbasE9Q411 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NbasE9Q411 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NbasE9Q411 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms